Cascadas Alcamayo befindet sich circa 6 Gehminuten vom Hotel Machupicchu Jonatan entfernt und ist einen Besuch wert. Das Economy-Hotel verfügt auch über Parkplätze.
Das Zentrum von Machu Picchu kann man fußläufig in 30 Minuten vom Hotel aus erreichen. Die Unterkunft ist zudem in einer 2 km Entfernung vom Inka-Pfad gelegen. Das Machupicchu Jonatan ist 10 Minuten Autofahrt vom Sonnenaltar und anderen beliebten Attraktionen von Machu Picchu entfernt. Die Bushaltestelle to Machu Picchu ist ganz nah am Hotel.
Das Restaurant Mapacho Craft Beer & Peruvian Cuisine bietet eine Auswahl von Gerichten und liegt zudem in rund 300 Meter Entfernung von der Unterkunft.